June 29, 2020

R:複数のCELファイルを読み込む

ワーキングディレクトリ内にある複数のCELファイルの名前を、以下のような文字列ベクトルに収めている際

cel_file <- c("a1.CEL", "a2.CEL", "a3.CEL")

AffyパッケージのReadAffy関数で読もうとすると失敗してしまう

cel_dat <- ReadAffy(cel_file)
→ Error : file names must be specified using a character vector, not a ‘list’

このエラーは、以下のようにして解決する

cel_dat <- ReadAffy(filenames = cel_file)

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